Dr Arindam Ghatak vun der Universitéit vu Wien huet High-Throughput Proteomics Profiler vun der Desiree Gromper Varietéit duerchgefouert fir en onbestëmmten iwwergräifend Bild vun den Ännerungen am Kartoffelproteom (d'Zomm vun alle Proteinen déi present sinn) als Reaktioun op verschidde Stresssituatiounen ze kréien.
D'Planzen goufen an engem Pilotexperiment an der Tschechescher Republik-baséierter PSI kultivéiert, e Projetspartner.
All Proteine goufen isoléiert a virfraktionéiert fir dës komplizéiert Untersuchung ier se verdaut a Massespektrometrie ënnerworf ginn, wat et erméiglecht Honnerte vu verschiddene Proteinen an enger eenzeger Probe z'entdecken an zousätzlech d'Quantifizéierung vun hirem Heefegkeet. D'Proteome Discoverer Software gouf duerno benotzt fir déi gesammelten Donnéeën ze analyséieren (Thermo, Däitschland). D'Proteine goufen identifizéiert mat der Solanum intern curated Datebank (generéiert vum NIB Institut, Ljubljana, Slowenien).
Vun der Recolte 1 (een Dag nom Stress) an der Recolte 3 am Ganzen, goufen 10341 Proteinen fonnt (8 Deeg nom Stress). An der Ernte 1 war de Waasserstress wou déi héchste Proteomemodulatioun gesi gouf. Hei hunn Proteine involvéiert an der Signaliséierung, de Lipidmetabolismus, an d'RNA Bindung erhéicht Aktivitéit am Verglach mat Kontrollen. Ähnlech, wärend Hëtztstress am Verglach mat Kontrollen, goufen Proteinen, déi an der Fotosynthese a sekundärem Metabolismus involvéiert sinn, erhéicht, wat de Stressreaktiounsmechanismus vum Proteome opgedeckt huet.
Am Aklang mat der Recolte 1, Recolte 3 huet och gewisen, datt Waasserlogging Stress, Hëtzt, an déi kombinéiert Effekter vun Hëtzt an Dréchent waren d'Belaaschtung déi stäerkste proteome Regulatioun identifizéiert. Am Verglach mat Kontrollen an aner Belaaschtunge gouf 14-3-3 Signaliséierung ënner dem Waasserloggingsstress erhéicht, wat Proteine beaflosst, déi als zu der funktioneller Kategorie vum Energiemetabolismus klasséiert sinn.
"Baséierend op der virleefeg Identifikatioun, Waasserlogging an Hëtztstress hunn déi stäerkst Regulatioun um Proteomniveau am Verglach mat anere Stress bewisen. Wéi och ëmmer, et wäert interessant sinn d'Proteome vun der Erhuelungsphase am Verglach mat anere Erntezäitpunkten ze kucken, besonnesch während Dréchentstress. Méi Datemining ass amgaang fir déif Informatioun iwwer d'Stressreaktiounsmechanismen vun de Planzen an d'Erhuelungsphase an der Gromper Varietéit Desiree ze kréien, "huet d'Wëssenschaftler geschriwwen.
Den Horizon 2020 EU-Projet Accelerated Development of Multiple-Stress TolerAnt Potato (ADAPT), un deem Europatat matmaacht, zielt nei Strategien z'entwéckelen fir d'Kartoffelen fit ze maachen fir déi usprochsvoll Wuesskonditioune vun der Zukunft.
Ee vun den Haaptziler vum Projet ass d'Kartoffelmorphologesch, physiologesch, biochemesch a molekulare Verännerungen an Äntwert op eenzel a kombinéiert Hëtzt, Dréchent a Waasserstress z'ënnersichen andeems se High-Throughput-Phenotyping an OMICS Technologien (Genomik, Transkriptomik, Proteomik, oder Metabolismus).
Eng Quell: https://www.potatobusiness.com